密碼子分析工具

密碼子使用頻率表

快速查詢常見物種密碼子使用頻率表,包括大腸桿菌、釀酒酵母、草地貪夜蛾、人HEK細胞、黑線倉鼠CHO細胞等

稀有密碼子分析工具

分析序列中的稀有密碼子并以圖表形式直觀展示在結果中,同時也會分析基因對宿主細胞的密碼子適應指數CAI

GC含量計算

GC含量又稱為G+C比值或GC比值,在序列中,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比率稱為GC含量。

密碼子適應指數(CAI)分析

輸入序列,計算目的基因在宿主細胞的CAI(密碼子適應指數)

遺傳密碼表及差異對照

展示常見的遺傳密碼子對照表并提供兩個遺傳密碼子表之間的差異對照

密碼子使用頻率計算

輸入序列,計算密碼子使用頻率,得到指定序列的密碼子使用頻率表

序列分析工具

信號肽分析

輸入序列,對序列中是否存在信號肽及信號肽位置進行分析

跨膜區預測

輸入序列,對序列中是否存在跨膜區及跨膜區位置進行預測。

疏水性分析工具

對序列進行疏水性分析

抗原決定簇預測(v1)

此工具可以展示五種蛋白抗原決定簇預測算法的數據,幫助進行抗原多肽的設計。

抗原決定簇預測(v2)

采用與BepiPred-2.0相同的算法,訪問速度比BepiPred-2.0快,操作更方便。1-2分鐘可得到分析結果

氨基酸屬性表及分子量分析

20種氨基酸的屬性及分子量對比列表

基因序列格式化工具

3s內將基因序列轉化為標準格式

蛋白序列格式化工具

3s內將蛋白序列轉化為標準格式

多肽或蛋白序列屬性計算器

快速得到多肽/蛋白的長度、分子量、等電點等屬性

基因重復序列計算器

分析得到序列中的重復序列,及重復序列的長度、位置、退火溫度等信息

蛋白分析工具

蛋白二級結構預測

利用chou&fasman預測方法對蛋白質的α-螺旋、β-折疊、β-轉角等二級結構進行預測

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